- مرکز تحقیقات آسیبهای روانی- اجتماعی
- مرکز تحقیقات بیماریهای مشترک انسان و دام
- مرکز تحقیقات زیست فناوری و گیاهان دارویی
- مرکز تحقیقات میکروب شناسی بالینی
- مرکز تحقیقات بیماریهای غیر واگیر
- مرکز تحقیقات سلامت و محیط زیست
- مرکز رشد فناوری سلامت
- واحد توسعه تحقیقات بالینی بیمارستان امام خمینی(ره)
- واحد توسعه تحقیقات بالینی بیمارستان شهید مصطفی خمینی
- واحد توسعه تحقیقات بالینی بیمارستان آیت اله طالقانی
- مرکز تحقیقات سل و بیماریهای ریوی